秋水仙碱与别嘌醇的区别在于药效以及作用机制。别嘌醇为抑制尿酸合成的药物，而秋水仙碱为痛风急性发作期的对症治疗药物，如果在急性发作期，患者使用秋水仙碱的同时也服用别嘌醇，可能会引起尿酸盐的活动，可能会加重患者的痛风。另外部分患者服药后，可能会出现皮疹、瘙痒等过敏反应。
秋水仙碱是治疗急性痛风性关节炎的特效药，抑制炎症细胞的变形和发展，从而改善炎症。而别嘌呤醇是抑制黄嘌呤氧化酶的药物，让尿酸生成减少。别嘌醇是降尿酸药物，在痛风的急性期不主张使用，因为降尿酸的药物会造成体内尿酸盐结晶溶解。从而导致尿酸的波动，很容易加重痛风症状。如果尿酸生成增多，可以使用别嘌醇等抑制尿酸生成的药物进行治疗。
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